Väike-Emajõgi - Limnoloogiajaam (ca 30km)
Algus Jõgeveste maanteesilla juurest (kõrval on kohe motell). Võrtsjärveni ca 15 km. Sealt edasi Pähksaarele ca 2 km ja Tondisaarele ca 12km. Siin on ka lõkkekoht. Võimalus ööbimiseks telkidega. Lähim randumiskoht kaldal kas Rannakülas või Limnoloogiajaamas. Väikse Emajõe suubumiskohast piki Võrtsjärve idakallast on Jõesuusse ca 32 km.
Jõesuu - Kärevere sild (ca 38km)
Retke algus Võrtsjärve külastuskeskuse ja vaatetorni juurest. Pede jõeni (Põltsamaa ja Pedja) on siit ca 7 km. (Pede jõge pidi ülesvoolu sõites on võimalik vasakkaldalt leida 1-2 ööbimiskohta lõkkeplatsiga.) Edasi tulevad Palupõhja ja Reku (ca 19 km). Emajõgi on sellel lõigul kõige käänulisem.
Kärevere sild - Tartu (ca 18km)
Tartu - Kantsi kõrts (ca 30km)
Kantsi Kõrts - Kalli jõgi - Ahunapalu (ca 23km)
See marsruut on eemal tsivilisatsioonist. Sõit kulgeb Emajõe Suursoos. Siin suubuvad Emajõkke Koosa, Ahja ja Kalli jõgi. Et Ahunapallu jõuda tuleb sõitu jätkata piki Kalli jõge. Peagi annab endast märku avar veeväli, milleks on Kalli järv. Järve lõunapoolsest osast pääseb taas jõele. Soovi korral on võimalus teha põige Leegu järvele.
Kantsi Kõrts - Piirissaare - Laaksaare (ca 38km)